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                      何川教授主要從事化學生物學、核酸化學和生物學、遺傳學等方面的研究

                        來自芝加哥大學、紀念斯隆凱特琳癌癥中心的研究人員報告稱,他們開發出了一種高度敏感、強大的方法分析液氮罐罕見細胞群的全基因組5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)。研究成果發布在7月28日的《分子細胞》(Molecular Cell)雜志上。

                        著名華人學者、芝加哥大學的何川(Chuan He)教授,與紀念斯隆凱特琳癌癥中心的Ross L. Levine是這篇論文的共同通訊作者。何川教授主要從事化學生物學、核酸化學和生物學、遺傳學等方面的研究。近年來在甲基化修飾,尤其是液氮罐5hmC和m6A等方面獲得了許多重要的發現。

                        迄今已在Nature,Science等國際權威學術期刊發表了150余篇論文。曾榮獲美國癌癥研究青年科學家獎,凱克基金會醫學研究杰出青年學者獎等多個獎項,并當選為頂級生命醫學研究院HHMI研究員。

                        今年1月,何川教授在Cell新子刊液氮罐Cell Chemical Biology上發表文章,全面探討了與基因表達調控有關的多種核酸修飾。何川教授對核酸修飾領域的發展史進行概述,著重介紹了核酸修飾鑒定和功能探索中取得的最新進展。

                        文章覆蓋了許多在生物系統中起重要調控作用的核酸修飾,包括DNA上的5mC及其衍生品、6mA,mRNA和長非編碼RNA上的m6A、假尿嘧啶(Ψ)和m5C。此外,文章還簡單闡述了其他非編碼RNA(何川教授全面解讀核酸上的那些液氮罐修飾 )。

                        2月,何川教授和芝加哥大學的Dan Dominissini,及以色列特拉維夫大學的Gideon Rechavi博士領導研究人員,描繪出了真核細胞信使RNA(mRNA)中動態的N1甲基腺苷(N1 methyladenosine,m1A)甲基化組。這一研究成果發布在Nature雜志上(何川教授Nature闡析新型RNA修飾 )。

                        7月2日,學術期刊《eLife》在線刊登了何川教授和液氮罐俄亥俄州立大學Li Wu領導的一項研究成果。研究結果指出了HIV-1 RNA的m6A修飾在病毒感染和HIV-1蛋白合成過程中所發揮的作用(何川教授eLife最新表觀遺傳學成果 )。

                        被稱為“第六種堿基”的5hmC廣泛分布于多種哺乳動物的組織和細胞中,與胚胎發育、神經系統功能以及腫瘤研究高度相關。與5-甲基胞嘧啶(5mC)相比,5hmC在組織中含量更低,難以精確地檢測。隨著研究的深入,5hmC參與的重要生物學液氮罐作用逐漸被人們發現,同時也促使著5hmC的檢測和定量方法不斷發展。

                        為了區分5hmC與其他胞嘧啶衍生物,很多利用化學或酶學修飾實現靶向檢測或非靶向富集5hmC的方法應運而生。因此,選擇并發展靈敏、準確、可靠的5hmC檢測技術對于表觀遺傳研究至關重要。

                        在這篇文章中,研究人員描述了一種高度敏感的選擇性化學標記和捕獲方法,采用分離自約1,000個細胞的DNA全基因組分析5hmC,他們將之命名為nano-hmC-Seal。利用這一技術,研究人員評估了跨越不同的造血分化階段液氮罐5hmC的分布和動態。

                        采用Nano-hmC-Seal分析Tet2突變的純化小鼠急性髓性白血病(AML)干細胞,他們發現相比正常干細胞它們具有一些白血病特異性、差異性羥甲基化區域,這些區域包含一些具有不同5hmC峰的已知和候選疾病特異性靶基因。在液氮罐AML中5hmC模式的改變與差異性基因表達密切相關,證實了在AML中5hmC動態改變對調控轉錄起重要作用。

                        新研究為在體內疾病模型及有限的臨床樣本中研究和檢測DNA甲基化動態提供了一種有效的方法。

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